【会议日程】
第一天
8:30--11:30 GROMACS上机实践1
完成水和有机溶剂（甲醇和环己烷）的参数设置和模拟，进行温度、密度、偶极矩、介电常数、蒸发焓、扩散系数、径向分布、粘度、表面张力、表面势能等计算分析。
学员在此阶段可学习Amber/Charmm力场参数的构建、标准的分子动力学计算流程、气相和液相体系的模拟设置，以及GROMACS内置的数据分析程序，以及加深对GROMACS文件类型、分子处理、参数设置和关键命令的理解。
GROMACS上机实践2
完成蛋白质、蛋白质/配体在水溶液中的模拟计算，分析蛋白质的柔性、二级结构、亲/疏水面积、回旋半径、蛋白质/配体的结合能、距离、氢键、静电和范德华作用等分析，同时尝试对氨基酸进行突变或修饰，并利用Discovery Studio Visualizer制作高质量三维结构图片。
学员在此阶段可学习GROMACS对蛋白质和配体坐标文件的处理命令，了解软件对混合分子体系（蛋白质/配体/离子/水）的参数设置以及力场文件的修改，掌握GROMACS软件对蛋白质体系的分析程序。
第三天
8:30--11:30GROMACS上机实践3
学员在此阶段可学习Autodock Vina刚性和柔性对接的方法，复合物的结构预测及结合能的计算，进一步复习GROMACS软件对蛋白质-配体复合物体系的处理和结果分析。
GROMACS上机实践5
学员在此阶段可学习GROMACS对膜蛋白体系、混合、核酸体系的处理和构建以及VMD软件对模拟轨迹文件的可视化，复习混合分子体系参数的设置，学习力场参数文件的获取和手动编辑。
GROMACS上机实践6
利用Martini力场完成环糊精和膜蛋白的粗粒化参数设置和模拟，比较全原子力场和粗粒化力场的差异和适用范围。加强学员对GROMACS软件适用范围、mdp和top文件类型的编写、系统平衡、时间步长选择、力场参数选择和构建、出错调试等一系列重要问题的认识。
【会议嘉宾】
张老师，工学博士，有丰富的GROMACS使用经验，运用GROMACS所做的科研工作已发表在Journal of Physical Chemistry Letter，Journal of Chemical Theory and Computation，Journal of Chemical Information and Modeling等国际学术刊物。
【会议门票】
培训班费用：（培训班费用不含差旅费、午餐费）
同一单位2人或以上参加，可享受优惠
| 人员 | 一人参加 | 两人及以上 |
| 老师 | 2600元/人 | 2300元/人 |
| 学生 | 2300元/人 | 2000元/人 |
（1）午餐可安排酒店自助餐，每天100元，算做培训费一同开发票。
（2）可以预订应物会议中心的住房，有单人大床房或者双人标间，价格都是350/天，住宿费用需学员自行向会议中心结算。
